Unidad de Proteómica

 

Datos de contacto:

Manuel Marcos - Paula Álvarez Chaver

986 130 129 - 986 813 884

Este enderezo de correo está a ser protexido dos robots de correo lixo. Precisa activar o JavaScript para velo.

 

A Unidade de Proteómica ofrece servizo para o estudo de proteínas aos investigadores da Universidade de Vigo e de outras institucións, tanto públicas como privadas. A proteómica defínese como o estudo do proteoma (conxunto de proteínas expresado polo xenoma completo dunha célula ou un tecido nun momento determinado, baixo precisas e determinadas condicións), mediante métodos bioquímicos de separación de proteínas a gran escala, co fin de obter una visión global e integrada dos procesos celulares.

 

O espectro de estudo da proteómica divídese en catro grandes áreas: proteómica de expresión, proteómica de expresión diferencial, proteómica de interaccións, estructural ou de mapa celular e a modificómica, que se centra na análise das modificacións post-traduccionais. Na Unidade de Proteómica realízase tanto a identificación de proteínas como a análise de expresión diferencial, seguindo tres aproximacións metodolóxicas:

 

1. Cuantificación relativa do nivel de expresión de proteínas mediante análise de imaxe de xeles:

  • Separación de proteínas mediante electroforese monodimensional en xeles de poliacrilamida, en condicións nativas (NATIVE-PAGE) ou desnaturalizantes (SDS-PAGE).
  • Separación de proteínas mediante electroforese bidimensional (2-DE), na que a separación en xeles SDS-PAGE é precedida por un fraccionamiento baseado no punto isoeléctrico (isoelectroenfoque, IEF).
  • Revelado de imaxe mediante tinción colorimétrica (Azul de Coomassie, Nitrato de Plata) ou fluorescencia (Sypro, Oriol, etc).
  • Adquisición, alineamento e análise de imaxes.

 

2. Identificación de proteínas mediante dixestión encimática seguida da análise por espectrometría de masas e a búsqueda en base de datos:

  • Análise de pegada peptídica (MALDI-MS) e de espectros de fragmentación de péptidos (MALDI-MS/MS). Utilízase para identificar proteínas purificadas, bandas de xeles SDS-PAGE e manchas proteicas de xeles 2-DE.
  • Separación de péptidos por cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (LC-MS/MS). Utilízase para identificar proteínas en mostras de complexidade moderada/alta, en termos de número de proteínas.

 

3. Identificación e cuantificación relativa do nivel de expresión de proteínas mediante análise por espectrometría de masas LC-MS/MS:

  • Marcaxe isobárico (iTRAQ e TMT). Permite a comparación de ata 10 mostras nun único análise de LC-MS/MS.
  • Sen marcaxe (Label-free).

 

Web desarrollada por Linckia